??从南洋公学到交通大学可以说西安交通大学和上海交通大学是相同的，因为那个时候两个学校是一个主体，直到1956年，出于社会主义建设和国防建设的需要，党中央、国务院决定交通大学由上海全部迁往西安。1956年起，交大师生把国家民族的要求与学校命运、个人发展紧紧地结合在一起，在彭康校长率领下积极开展迁校工作。1957年，由于国际形势趋于缓和，根据交通大学的实际情况和上海、西安两地的建设需要，国务院决定交通大学的大部分科系师生、档案文献、图书仪器迁往西安，作为交通大学的西安部分；小部分留在上海并与原上海造船学院及筹办中的南洋工学院合并，作为交通大学的上海部分，两部分为
一个学校，统一领导。可以说那个时候的交通大学西安部分为交通大学的正统，设备及师资力量远远要超过当时的交通大学上海分校，并且1957年西北工学院的地质系、采矿系、纺织系和西北农学院水利系、土壤改良系以及西安动力学院并入交通大学西安部分。及实力又大大增强。而到了1959年交通大学上海部分也得到了长足发展，与交通大学西安部分均列为国家重点大学之一。两所学校相距又远，且当时国际时态有趋于缓和，再加上管理不便，教育部允许交通大学西安部分和上海部分分别独立建校，交通大学西安部分被定名为“西安交通大学”交通大学上海部分被定名为“上海交通大学”原交通大学校长彭康被任命为西安交通大学校长。至此两校正式分裂。
上交大争超赶上位列“清北复交”
分裂之后，上海交通大学得力于上海的迅速发展，发展势头远超西安交通大学，1995年12月，上海交大被列为国家“211工程”重点建设院校。1999年7月，学校被列为国家“985工程”重点建设院校。9月1日，学校举行庆祝上海农学院并入上海交通大学暨上海交通大学农学院成立大会，2005年7月18日，上海第二医科大学与上海交通大学合并，成立了由教育部、上海市人民政府重点共建的上海交通大学医学院。2009年4月，上海市人民政府依托学校成立上海交通大学上海高级金融学院；被教育部评为“全国毕业生就业典型经验高校”。5月，进入教育部、农业部合作共建全国八所涉农高校行列。同年，入选国家“珠峰计划”。 短短几十年的发展上海交通大学已然仅次于清北，欲与复旦试比高。
精益求精西交大西北称霸
西安交通大学近几十年虽没有上海交通大学那么耀眼，但是也是国家教育部直属重点大学，首批进入国家“985工程”重点建设九所大学之一、首批进入国家“2110工程”建设的九所大学之一。教育部第四轮学科评估中西安交通大学A+档（2个）：动力工程及工程热物理、电气工程。A档（4个）：数学、力学、机械工程、工商管理。A-档（8个）：应用经济学、马克思主义理论、材料科学与工程、
电子科学与技术、控制科学与工程、计算机科学与技术、管理科学与工程、公共管理。在2018年软科世界一流学科排名中该校的机械工程学科位列全球高校第二，实力仅次于剑桥大学。